教你用Pytorch搭建一个自己的简单的BP神经网络( 以iris数据集为例 )

目录

数据集

构造函数: 确立一个网络

关于forward

完成一次训练

循环训练与测试

运行结果

GPU与CPU对比

我的历史遗留问题

前言:为什么想写这个博客

前阵子学习MASP的时候接触到了Python的torch库, 了解了Python搭建网络的便捷与方便, 很想模仿构建一个自己的简单网络, 方便自己查阅学习.

而且之前我模仿老师的BP神经网络代码(BP纯源码)写过一篇自学BP神经网络的博客:

基于 Java 机器学习自学笔记 （第71-73天：BP神经网络）_LTA_ALBlack的博客-CSDN博客注意：本篇为50天后的Java自学笔记扩充，内容不再是基础数据结构内容而是机器学习中的各种经典算法。这部分博客更侧重于笔记以方便自己的理解，自我知识的输出明显减少，若有错误欢迎指正！https://blog.csdn.net/qq_30016869/article/details/124902680 ;同时也花时间整理过激活函数和模块化的BP神经网络, 但是无论怎么说, 无轮子的纯代码编写还是比较麻烦的, 但是使用了轮子很多内容就变得简单了. 而且torch本身是兼容GPU加速的, 很适用于大型网络, 因此我感觉有必要再用torch重写下当时的代码, 与此同时也梳理下我当时写模块化BP网络时遇到的ReLU激活函数的问题.

当然最重要的就是为我以后的神经网络编写提供参考, torch还是很方便的, 有了这篇博客, 我应该能很快就搭好一个基本正确的网络 !

数据集

@RELATION iris

@ATTRIBUTE sepallength  REAL
@ATTRIBUTE sepalwidth   REAL
@ATTRIBUTE petallength  REAL
@ATTRIBUTE petalwidth   REAL
@ATTRIBUTE class    {Iris-setosa,Iris-versicolor,Iris-virginica}

@DATA
5.1,3.5,1.4,0.2,Iris-setosa
4.9,3.0,1.4,0.2,Iris-setosa
4.7,3.2,1.3,0.2,Iris-setosa
4.6,3.1,1.5,0.2,Iris-setosa
5.0,3.6,1.4,0.2,Iris-setosa
...

7.0,3.2,4.7,1.4,Iris-versicolor
6.4,3.2,4.5,1.5,Iris-versicolor
6.9,3.1,4.9,1.5,Iris-versicolor
5.5,2.3,4.0,1.3,Iris-versicolor
6.5,2.8,4.6,1.5,Iris-versicolor
...

6.3,3.3,6.0,2.5,Iris-virginica
5.8,2.7,5.1,1.9,Iris-virginica
7.1,3.0,5.9,2.1,Iris-virginica
6.3,2.9,5.6,1.8,Iris-virginica
6.5,3.0,5.8,2.2,Iris-virginica

iris是一个相对简单的数据集, 表示花的种类, 一共3标签, 是一个简单三分类(请区别与多标签), 因此我们可以得到基本的标签矩阵：

[[1,0,0]
 [1,0,0]
 [1,0,0]
 [1,0,0]
...

 [0,1,0]
 [0,1,0]
 [0,1,0]
 [0,1,0]
...

 [0,0,1]
 [0,0,1]
 [0,0,1]
 [0,0,1]]

如果是多标签的话, 每个标签行” 1 “的个数就不是固定的一个了

然后我写了一个极其简易的读iris的代码, 具体其他数据集再根据情况写自己的reader吧, 其实许多规范的数据集是以标准的标签或者数据矩阵形式的.mat文件体现, 那时写的代码可能更有代表性吧.

import re
import numpy as np

class Dataset:

    trainingSet: np.array
    trainingLabelSet: np.array
    testingSet: np.array
    testingLabelSet: np.array

    def __init__(self, fileName, trainingSetProportion):
        '''
        Construction

        :param fileName: File path and name
        :param trainingSetProportion: Percentage of training data in total data
        '''

        dataSet = []
        labelSet = []

        file = open(fileName, 'r', encoding='utf-8')
        filecontent = file.read()
        classList = []
        for i in filecontent.split('\n'):
            if len(i) == 0:
                continue
            if i[0] == '@' and i.find('class') != -1:
                innerStr = re.findall(r'[{](.*?)[}]', i)
                classList =  innerStr[0].split(',')
                continue
            if i[0] in ['%','@']:
                continue
            rowStr = i.split(',')
            dataSet.append(rowStr[0:4])
            tempList = []
            for className in classList:
                tempList.append(int(className == rowStr[-1]))
            labelSet.append(tempList)
        # convert to numpy
        tempDataSetNumpy = np.array(dataSet, dtype=np.float32)
        tempLabelSetNumpy = np.array(labelSet, dtype=np.float32)
        # confirm size
        allSize = len(dataSet)
        rowIndices = np.random.permutation(allSize)
        trainSize = int(allSize * trainingSetProportion)
        # for train
        self.trainingSet = tempDataSetNumpy[rowIndices[0:trainSize], :]
        self.trainingLabelSet = tempLabelSetNumpy[rowIndices[0:trainSize], :]
        # for test
        self.testingSet = tempDataSetNumpy[rowIndices[trainSize:allSize], :]
        self.testingLabelSet = tempLabelSetNumpy[rowIndices[trainSize:allSize], :]

        file.close()

我用的是numpy中存储矩阵的np.array格式存储数据矩阵与标签矩阵, for循环之后就是按照trainingSetProportion分割为数据集与测试集, 分割标签数据集与标签测试集.

训练集

训练标签集

测试集

测试标签集

构造函数: 确立一个网络

注: 本篇文章您可能需要下面一些库:

import numpy as np
import torch
from torch import nn
import re

Pytorch中要搭建一个网络往往都需要合理继承nn.Module这个类, 而在构造这个类的时候往往就定义了其网络的框架.

这里我设计了三个形参: 层数列表, 激活函数字符串, 学习因子(梯度步长)

具体可以根据自己需求做变化, 比如可以加入读取数据集路径, 这个我单独用一个setter完成了, 若不是集体管理的代码, 那么编程可以灵活随意的.

class baseAnn(nn.Module):

    def __init__(self, paraLayerNumNodes: list = None, paraActivators: str = "s" * 100, paraLearningRate: float = 0.05 ):
        '''
        Contruction, Create a neural network

        :param paraLayerNumNodes: A list is used to describe each layer of network nodes
        :param paraActivators: A string is used to describe each layer activators
        :param paraLearningRate: Learning Rate
        '''
        super().__init__()
        self.dataset: np.array
        self.device = torch.device("cuda")
        tempModel = []
        for i in range(len(paraLayerNumNodes) - 1):
            tempInput = paraLayerNumNodes[i]
            tempOutput = paraLayerNumNodes[i + 1]
            tempLinear = nn.Linear(tempInput, tempOutput)
            tempModel.append(tempLinear)
            tempModel.append(getActivator(paraActivators[i]))
        self.model = nn.Sequential(*tempModel)
        self.optimizer = torch.optim.Adam(self.model.parameters(), lr=paraLearningRate)
        self.lossFunction = nn.MSELoss().to(self.device)
    def setDataSrc(self, dataSrc, trainingSetProportion):
        '''
        Read the data by path

        :param dataSrc: Dataset path
        :param trainingSetProportion: Percentage of training data in total data
        :return: Dataset
        '''
        self.dataset = Dataset(dataSrc, trainingSetProportion)

    ...

    ...

self.device = torch.device(“cuda”) (或者写为’cuda:0′) 声明了使用的设备. torch.device代表将torch.Tensor分配到的设备的对象, 有cpu和cuda两种. 而这里写的为何是”cuda”而不是”gpu”呢? 因为gpu本身没法参与到编程中来, 必须要通过cuda作为中间代理.

CUDA（Compute Unified Device Architecture），是显卡厂商NVIDIA推出的运算平台。 CUDA™是一种由NVIDIA推出的通用并行计算架构，该架构使GPU能够解决复杂的计算问题。 它包含了CUDA指令集架构（ISA）以及GPU内部的并行计算引擎。
CUDA就是一个软件编程的框架，将很多底层通用的代码集成了，有了这个框架我们就可以减少编程的工作量，非常方便我们调用GPU，所以 CUDA是一个方便我们编写代码调用GPU的框架。(来自这位博主总结)

简单来说, 如果你的电脑是N卡那么就能很好兼容cuda, 利用GPU跑程序, 在网络层数比较多时将会非常快. 如果是A卡似乎要实现兼容会非常麻烦.

这里附上CUDA安装教程(CUDA安装教程（超详细）_Billie使劲学的博客-CSDN博客_cuda安装)

注: 使用torch.cuda.is_available() 可以返回当前是否可用cuda.

同时在指定的命令后添加to然后声明使用的设备可以实现运行的准换

例如上面的第21行 self.lossFunction = nn.MSELoss().to(self.device) 就是将声明的损失函数挪到了GPU上运行. 结合我的使用体验来看, 一个代码中需要使用GPU指明运行端的主要有三个地方:

1. 将矩阵从numpy中的矩阵转化为torch中的tensor矩阵时. 常见代码转化代码为: ” torch.as_tensor() .to(self.device)” 括号内填入一个numpy矩阵.

2. 在声明网络对象时要使用GPU, 例如我现在构建的网络类是baseAnn, 那么在声明对象时不要单纯写作:” ann = baseAnn([4,64,64,64,3], “ssss”, 0.01) “而需要写为” ann = baseAnn([4,64,64,64,3], “ssss”, 0.01).cuda()” 这里使用.cuda() 与 .to(torch.device(“cuda”))是等价的.

3. 声明损失函数时: self.lossFunction = nn.MSELoss().to(self.device)

记住! 对于小体量的网络, 使用GPU并没有比CPU的优势, 但是对于超大型的网络的话时间开销提升就会非常大, 这个我在文章最后会进行简单测试.

这用了nn.Sequential方法来构造网络, 这种方法对于简单的串行网络定义更加灵活快捷. 只需要知道网络层数目列表与激活函数字符串, 然后对于层数列表进行遍历即可. 每次遍历都选择相邻两层设置线性层(nn.Linear), 然后将线性层加入列表, 之后再加入激活函数. 这就是12~18行代码的描述. 19行通过nn.Sequential(tempModel)将列表内的数据提取出来(Python的可将(x,…,z)分解为x,..,z), 构成了最终self.model网络.

20行的torch.optim是一个实现了多种优化算法的包, 在使用之前需要构造一个优化器对象self.optimizer用来保存当前的状态, 不同的优化函数有不同的形参方式, 但是统一地都需要一个可进行迭代优化的包含了所有参数的列表, 这个可以通过self.model .parameters() 获取. 这个优化器的设置是必须的, 因为后面需要它来 确定初始梯度与 更新权值.

Adam算法：
adam算法来源：Adam: A Method for Stochastic Optimization
Adam(Adaptive Moment Estimation)本质上是带有动量项的RMSprop，它利用梯度的一阶矩估计和二阶矩估计动态调整每个参数的学习率。它的优点主要在于经过偏置校正后，每一次迭代学习率都有个确定范围，使得参数比较平稳.

常见的可以使用的算法库有Adadelta, Adagrad, Adam, AdamW, SparseAdam, Adamax, ASGD, LBFGS, RMSprop, Rprop, SGD

图中激活函数getActivator(paraActivators[i])进行了简写, 这个源于下面这样的函数:

def getActivator(paraActivator: str = 's'):
    '''
    Parsing the specific char of activator

    :param paraActivator: specific char of activator
    :return: Activator layer
    '''
    if paraActivator == 's':
        return nn.Sigmoid()
    elif paraActivator == 't':
        return  nn.Tanh()
    elif paraActivator == 'r':
        return nn.ReLU()
    elif paraActivator == 'l':
        return nn.LeakyReLU()
    elif paraActivator == 'e':
        return nn.ELU()
    elif paraActivator == 'u':
        return nn.Softplus()
    elif paraActivator == 'o':
        return nn.Softsign()
    elif paraActivator == 'i':
        return nn.Identity()
    else:
        return nn.Sigmoid()

关于forward

网络的训练无非是由一次forward和backPropagation(附边权更新)构成.因为原生的nn.Module其实是携带了forward方法的, 所以每次编写forward本质上是重写(见下), 要实现forward方法非常简单, 只需要额外补充下面这样一个简单的代码就好了

    def forward(self, paraInput):
        return self.model(paraInput)

初见这个重写定然会有一些疑惑, 一步步来解释.

这里调用forward时有一个Python的语法特征, 我们并没有直接使用self.forward(data)来使用正向传递, 而是直接调用我们声明的网络模型self.model且使用()方法: self.model(data)来调用.

这是来源于Python中的__call__语法, 只要定义一个def call(self, data): 函数, 那么直接对于这个__call__函数所修饰类对象直接使用()方法就可以进行调用.

class Module():
    def __call__(self, paraData):
        print('I call a parameter: ', paraData)

module = Module()
module(233)

输出:

233

因此self.model(data)本质上就是调用了call方法.

而nn.Module中的__call__中包装了神经网络正向传播的细节, 这里我们不要过度在意, 因为我们直观如何使用就好啦. 对于我们使用者, 唯一需要注意的就是把单次的__call__处理进行多次迭代(因为网络正向传递就是许多forward的串联, 或者说是迭代), 而__call__源码中预留了一个出口:

通过这个出口可以跳转到可重写的self.forward()函数中, 于是我们可重写self.forward()函数并在其中添加 _再进入call_的入口(self.forward()), 实现源call__代码的反复迭代. 至于说, 最终到达输出部分怎么退出? 这个问题在源码中封装好了, 不用担心.

于是就有了下面这个代码:

    def forward(self, paraInput):
        return self.model(paraInput)

它不是正向传递的全部, 而仅仅是内置正向传递代码进行迭代连接的” 关节“

然后在其他成员函数想要设计训练代码时若想使用完整的正向传递, 使用self.forward(data)与self.model(data)其实就是一样的了. 习惯来说, 大家都用的是self.module(data), 没必要多调用一个函数, 而self.forward(data)单纯作为一个迭代部件就好了.

注意: call方法调入的形参必须是一个torch中的tensor矩阵 !

完成一次训练

再次说明, 训练无非是由一次forward和backPropagation(附边权更新)构成.

    def oneRoundTrain(self):
        '''
        Finish single training to trainingSet

        :return: Loss value
        '''
        if self.dataset == None:
            print("Please load the dataset first")
            return

        tempInputTensor = torch.as_tensor(self.dataset.trainingSet).to(self.device)
        tempOutputsTensor = self.model(tempInputTensor)

        tempTargetsTensor = torch.as_tensor(self.dataset.trainingLabelSet).to(self.device)
        loss = self.lossFunction(tempOutputsTensor, tempTargetsTensor)

        self.optimizer.zero_grad()

        loss.backward()

        self.optimizer.step()

        return loss.item()

• 第6行, 将数据集的numpy矩阵转变为torch的tensor矩阵, 这个过程需要搭载到gpu上运行

• 第7行, 即调用forward正向传递, 最后返回一次正向传递获得的预测tensor矩阵.

• 第9,10行, 之后标签矩阵也转换为tensor对象, 一并放入损失函数self.lossFunction计算损失函数.

• 第12行, 之后self.optimizer.zero_grad()通过optimistizer将梯度设置为0

• 第14, 16行 通过损失函数结果本身自带的backward()函数进行逆向计算惩罚信息, 最后再通过优化器optimizer更新权值, 代码为self.optimizer.step().

loss是张量对象, 而item()取出了里面的数组, 返回最终损失函数的计算值, 这个值可以作为当前网络拟合状况的度量, 越小说明拟合最好. 通过观察发现通过函数使用深入这个值是在不断减少的.

循环训练与测试

训练与测试可以根据自身数据的情况做出改进, k-折交叉, batch测试等等, 我这里用相对简单的测试集与训练集分离并且单一的循环测试.

循环训练思想是先进行指定回合的训练, 然后不断再进行测试, 根据测试的准确度提升量再确定训练的终点. 后者能避免一味增大相似度从而导致的过拟合.

• 函数确定形参paraLowerRound, 表示训练回合; paraEnhancementThreshold, 表示准确度提升量阈值, 即精度阈值.

• 执行paraLowerRounds次训练.

• 进行永循环, 每次循环时进行一次测试.

• 当测试的准确度相比上次准确度来说, 提升值低于paraEnhancementThreshold时, 结束循环.

    def predictForTrainingSet(self):
        '''
        Predicting the trainingSet

        :return: Predictive accuracy
        '''
        tempInputTensor = torch.as_tensor(self.dataset.trainingSet).to(self.device)
        predictionTensor = self.model(tempInputTensor)
        index = 0
        correct = 0
        for line in predictionTensor:
            if(line.argmax() == self.dataset.trainingLabelSet[index].argmax()):
                correct += 1
            index += 1
        return float(correct / index)
    def predictForTestingSet(self):
        '''
        Predicting the testingSet

        :return: Predictive accuracy
        '''
        tempInputTensor = torch.as_tensor(self.dataset.testingSet).to(self.device)
        predictionTensor = self.model(tempInputTensor)
        index = 0
        correct = 0
        for line in predictionTensor:
            if(line.argmax() == self.dataset.testingLabelSet[index].argmax()):
                correct += 1
            index += 1
        return float(correct / index)

    def boundedTrain(self, paraLowerRounds: int = 200, paraCheckingRounds: int = 200, paraEnhancementThreshold: float = 0.001):
        '''
        Multiple training on the data

        :param paraLowerRounds: Rounds of Bounded train
        :param paraCheckingRounds: Periodic output of current training round
        :param paraEnhancementThreshold: The Precision of train
        :return: Final testingSet Accuracy
        '''
        print("***Bounded train***")
        # Step 2. Train a number of rounds.

        # 指定回合数的训练
        for i in range(paraLowerRounds):
            if i % 100 == 0:
                print("round: ", i)
            # 以当前传入的三个矩阵完成对于temp_input的训练,  temp_extended_label_matrix作为目标值
            self.oneRoundTrain()

        # Step 3. Train more rounds.

        # 继续训练, 当训练到提升幅度低于某个阈值时便停止
        print("***Precision train***")
        i = paraLowerRounds
        lastTrainingAccuracy = 0
        while True:
            # 训练并获得第一次训练的损失值
            tempLoss = self.oneRoundTrain()
            # 碰到检查点 输出训练效果
            if i % paraCheckingRounds == paraCheckingRounds - 1:
                tempAccuracy = self.predictForTestingSet()
                print("Regular round: ", (i + 1), ", training accuracy = ", tempAccuracy)
                if lastTrainingAccuracy > tempAccuracy - paraEnhancementThreshold:
                    break  # No more enhancement.

                else:
                    lastTrainingAccuracy = tempAccuracy
                print("The loss is: ", tempLoss)
            i += 1

        # 输出当前模型的最终测试数据
        result = self.predictForTestingSet()
        print("Finally, the accuracy is ", result)
        return result

这里引入paraCheckingRounds是为了定期进行输出, 方便对于运行情况进行监控.

前两个函数是分别是按照网络对于训练集和测试集的预测, 预测值由正向传播得到.

运行结果

if __name__ == "__main__":
    ann = baseAnn([4,64,64,64,3], "ssss", 0.01).cuda()
    ann.setDataSrc("D:\Java DataSet\iris.arff", 0.7)

    timerStart = time.time()
    ann.boundedTrain(500,100)
    timerEnd = time.time()
    print('time cost: ', 1000 * (timerEnd - timerStart), "ms")

隐层有三个, 深度都为64, 暂时都采用sigmoid作为激活函数.

运行结果(GPU-最大64层)

运行时间有些长? 确实对于这样小型简单的数据集没必要设置如此深度的网络

接下来横向比对我在我写的无轮子的BP神经网络的博客中使用的层数[4,8,8,3]

运行结果(GPU-最大8层)

因为网络存在随机性, 准确度不是稳定的, 但是可以确定的是, 最终识别度稳定性是比较高的.

但是这样的结果也要比我之前的无轮子纯BP代码的效果要好很多, 更少的训练结果获得了更好的效果

之前无轮子的运行结果(源码见:
,https://blog.csdn.net/qq_30016869/article/details/124902680)

GPU与CPU对比

上面将网络隐层深度从64->8, 本来是很大程度的削减, 但是时间削减并不大, 2822->2491,稍微比我们希望的还是长了点, 这应该GPU的问题, GPU运行小体量网络其实没有CPU那么好, GPU的优势还是高维度的图像数据.

下面是去掉cuda使用 CPU跑的效率.

运行结果(CPU-最大8层)

2491ms vs. 465ms, 可以说GPU在深度为8的网络中完败与CPU. 其实再把深度扩大到16,32,64…效果也是如此.

但是当我们把层数扩大到比较可怕的大小的时候, 结果就完全不一样了, 当层数变为[4,1024,1024,1024,3] CPU与GPU的效果如下:

运行结果(CPU-最大1024层)

运行结果(GPU-最大1024层)

可以非常显然发现, 网络大了后GPU对CPU呈现碾压的态势, 速度快了13倍 !

我的历史遗留问题

之前我模仿老师的模块化BP网络代码时(文章: https://blog.csdn.net/qq_30016869/article/details/125015490), 采用ReLU类激活函数之后效果非常糟糕. 这是当时的平均效果运行图:

当时我分析的原因是代码中采用了最简陋的随机化初始网络边权, 同时在backPropagation过程中的梯度下降方案也是比较单一的求导, 没有很好的优化措施, 例如可能的一些正则惩罚之类的. 最终导致梯度爆炸或者梯度消失等现象, 当时的网络设置还没有很好的兼容性, 很大程度还是面向sigmoid的网络.

但是Pytorch的nn.Module本身提供了非常多的初始化策略, 而Pytorch默认初始化方式大概率应该是kaiming_normal. 为何说大概率呢? 因为早期版本中的源码其实策略发生过变化的. 早期的版本用的是Xavier, 后期的版本才是kaiming_normal.

kaiming初始化方法, 源于论文 Delving deep into rectifiers: Surpassing human-level performance on ImageNet classification

公式推导同样从”方差一致性”出法，kaiming是针对Xavier初始化方法在ReLU这一类激活函数表现不佳而提出的改进, 详细可以参看论文. 因此在Pytorch在激活函数中很好兼容了Relu.

最终得到的运行结果与过去的运行结果对比见下图:

带轮子与不带轮子的不同激活函数的运行差异

可以非常明显发现使用了包之后因为兼容了更多的优化策略, 整体识别度有较大提高(注: 每个值都是多次测试取平均得到的结果), 这里所有ReLU的优化版激活函数都得到了逼近1.0的Accuracy, 而ReLU因为本身的一些缺陷和网络层数太小, 所以平均Accuracy并不是很高. 实际在测试中, 随着ReLU的层数和深度的增加, 识别率存在一定的提升.

(Pytorch没有arctan的激活函数, 故删去了这一项与曾经代码的比对~)

总结来看, 使用Pytorch和轮子真香!!

Original: https://blog.csdn.net/qq_30016869/article/details/125425235
Author: LTA_ALBlack
Title: 教你用Pytorch搭建一个自己的简单的BP神经网络( 以iris数据集为例 )